Торговые организации могут одновременно осуществлять как облагаемые, так и не облагаемые (п. 2 ст. 146, ст. 149 НК РФ) НДС операции, а также вести деятельность, переведенную на уплату ЕНВД.

С 1 января 2006 г. изменился порядок обложения НДС. Однако не все поправки связаны с изменением норм гл. 21 НК РФ, некоторые затрагивают правила обложения НДС, так как документооборот, который связан со счетами-фактурами, должен напрямую согласовываться с данными, отражаемыми в налоговых декларациях по НДС. С 1 января 2006 г. выплата НДС поставщику не является обязательным условием для принятия НДС к вычету.

Покупатель отражает реквизиты полученного счета-фактуры в книге покупок, и на основании этих документов он делает соответствующие записи в налоговой декларации и производит вычет «входного» НДС. Однако регистрировать счет-фактуру в книге покупок и предъявлять налог к вычету можно, только если счет-фактура оформлен надлежащим образом (ст. 169 НК РФ).

Счет-фактуру оформляют только плательщики НДС, к ним не относятся продавцы, применяющие специальные налоговые режимы (УСН, ЕНВД, ЕСХН). Если лицо, применяющее специальный режим, нарушит требования НК РФ и выпишет покупателю счет-фактуру с выделенной суммой НДС, то такое лицо должно перечислить в бюджет сумму налога, указанную в счете-фактуре (п. 5 ст. 173 НК РФ).

Если торговая организация освобождается от уплаты НДС на основании ст. 145 НК РФ, такие организации также обязаны выписывать счета-фактуры, как того требует п. 3 ст. 169 НК РФ, а на счетах-фактурах следует делать надпись «Без НДС». Нумерация счета-фактуры должна быть возрастающей и сквозной (т. е. без пропусков), требований к структуре номера нормативными документами не установлено.

От обязанности выставлять счета-фактуры освобождены предприятия розничной торговли, общепита и другие организации и индивидуальные предприниматели, работающие с населением (п. 7 ст. 168 НК РФ).

У налогоплательщиков, работающих с населением, обязанность по выставлению счетов-фактур считается выполненной, если они выдали покупателю кассовый чек или бланк строгой отчетности, счет-фактура такому покупателю не нужен.

Рядом с номером счета-фактуры указывается дата его выписки (п. 3 ст. 168 НК РФ), счет-фактура при реализации товаров (работ, услуг) выставляется не позднее 5 дней с момента отгрузки. Причем отсчет нужно начинать от даты отгрузки, а не со следующего дня. Правило о пятидневном сроке не применяется, если отгрузка произошла в последние 4 дня месяца. В такой ситуации счет-фактура выписывается в текущем месяце и регистрируется в книге продаж на соответствующую дату. Налогоплательщика, который выпишет счет-фактуру позже и на этом основании не отразит начисление НДС в налоговой декларации, при налоговой проверке ждут доначисление налога, штраф за несвоевременную уплату НДС и пени (письмо Минфина России от 23 июня 2004 № 03-03-11/107 «О принятии к вычету НДС на основании счетов-фактур, которые поступили с опозданием»).

К обязательным реквизитам счета-фактуры относятся наименование продавца и покупателя, их адреса, а также ИНН и КПП. Если продавец и грузоотправитель – одно и то же лицо, в строке 3 можно не повторять его наименование и адрес, ограничиться указанием «Он же». Но если покупатель является грузополучателем, делать такую же отметку в счете-фактуре нельзя (письмо МНС России от 13 мая 2004 № 03-1-08/1191/15® «Свод писем по применению действующего законодательства по НДС за второе полугодие 2003 г. – I квартал 2004 г.)». Дело в том, что строка 4, предназначенная для отражения данных о грузополучателе, расположена перед строками 6 и 6а, в которых приводятся наименование и адрес покупателя. Поэтому слова «Он же» в строке 4 счета-фактуры неуместны. В случае налоговой проверки налогоплательщику придется доказывать, что «Он же» – это не продавец, данные о котором приведены выше, а покупатель, наименование и адрес которого указаны внизу.